Depuis 2004, le Conseil général favorise l'émergence de plusieurs filières spécialisées : les pôles de compétences. L'émergence de pôles de compétences diminue les risques de délocalisations.
Logistique
Pour dynamiser la logistique, un secteur en plein essor, le Département accompagne des projets. Depuis 2004, il a ainsi investi près de 6 000 000 d'euros sur le secteur La Brohinière/Saint-Méen-le-Grand/Gaël: réhabilitation de la voie ferrée La Brohinière-Mauron, aménagement et extension de parcs d'activité...
Industrie et haute technologie
Le Conseil général veut renforcer les biotechnologies marines à Saint-Malo, la productique, les technologies de l'information et de la communication (les TIC) et l`automobile haut de gamme à Rennes.
Santé animale
Le Conseil général d'Ille-et-Vilaine a décidé, en 2005, de transférer l'Institut en Santé Agro-Environnement de Rennes à Fougères. Objectif ? créer BioAgroPolis, un pôle d'excellence dédié à la santé animale et à l'agro-environnement, en s'appuyant notamment sur la présence de l'Agence française de sécurité sanitaire des aliments, l'Afssa.